ההרכב הכימי של שום מורכב מאוד. בנוסף לחומרים פעילים ייחודיים של שום 39, תרכובות אורגניות המכילות גופרית, הוא עשיר גם בפוליסכרידים, חלבונים, שמנים נדיפים, חומצות אמינו, ויטמינים, ספונינים, פלבנואידים, פוליפנולים ולקטינים. פרוסטגלנדינים, אנזימים פעילים ביולוגית, וחומרים עשירים ביסודות מקרו ועקבות. מרכיבים מורכבים אלה הכלולים בשום הם הבסיס החומרי לפעילות פרמקולוגית של שום.
